Yugi Muto / Yami Yugi
Ver artigo principal: Yugi Muto
Yugi ganhou o seu Quebra-cabeças do milenio de seu avô. Quando finalmente conseguiu montá-lo ele liberou o espírito do antigo faraó do egito, Yami Yugi.
No reino dos duelistas Pegasus o desafia para testar e pegar o seu item do milenio.

Ryo Bakura / Yami Bakura
Ver artigo principal: Ryo Bakura
Bakura é um amigo de Yugi Muto. Ele é o possuidor do Anel do Milênio. Porém, junto com o anel, havia um espírito maligno, mais tarde conhecido como Yami Bakura.
Bakura quer juntar todas as relíquias do milenio e tenta fazer isso no reino dos duelistas, mas Yami Bakura é morto em um duelo contra Yugi. Apesar disso ele deixa uma parte de sua alma com Roy Bakura e continua a viver.
Bakura perde o anel quando Tristan o tira e joga fora. Mas, com o artefato misteriosamente reaparecido, ele desafia um enfraquecido e derrotado Pegasus para uma rápida disputa de poderes e obtém o Olho do Milênio dele.

Pegasus
Ver artigo principal: Maximillion Pegasus
Pegasus descobriu recebeu de Shadi a sua Relíquia do Milênio enquanto estava no Egito. O Olho do Milênio permitia a Pegasus ler as mentes das pessoas fazendo com que ele pudesse sempre prever as estratégias do adversário.

Jobson Karpinski
Conseguia clones perfeitos de cartas de todos os outros lutadores do jogo, sendo assim uma batalha dificil era contra ele. Apesar de Nunca ser o campeão, Jobson carrega o titulo em pensamento.

Marik Ishtar
Ver artigo principal: Marik Ishtar
Sua família guardou o túmulo do faraó por gerações. Marik guarda a Vara do Milênio e com a organização dos Ghouls, ele deseja obter as três cartas dos deuses, para então, liberar seu poder para si mesmo ganhando o título de Faraó e libertando o seu povo. Ele também tem um outro plano secreto: vingar o assassinato de seu pai pelo antigo faraó - isso é o que lhe fizeram acreditar. É irmão de Ishizu Ishtar.

Ishizu Ishtar
Ishizu Ishtar (イシズ・イシュタール Ishizu Ishutāru) pertence à família dos guardadores da tumba do Faraó. Nas Filipinas, é dublado como Eunice ao invés de Ishizu.

Shadi
Shadi é possuidor da chave do milenio que tem a habilidade de poder descobrir a verdade e entrar na mente das pessoas.Faz sua primeira aparição no anime no final da primeira temporada e tenta vasculhar a mente do jovem Yugi Moto porém se surpreende ao descobrir sobre o espirito do faraó que habita em sua mente.